Caja de cambios

Buenos días, lleve el coche al taller porque hacía un ruido que se notaba cuando el coche estaba arrancado pero parado. Además al tocar el embrague variaba el ruido. El mecánico rápidamente dijo que era el embrague y se lo debía cambiar.
Cuando se lo cambio y lo fui a recoger volví a notar que hacía ruido pero no tanto así que se quedo en el taller, me dijo al volver a revisarlo que los cojines del motor estaban gastados y que le podria un taco para que no sonase así, que era algo que no tenía importancia.
A los 3 días he tenido que volver a llevarlo porque el ruido ahora era mucho mayor e incluso volvió a sonar de la misma forma tocando el embrague.
Ahora el mecánico dice que se equivoco que no era el embrague, que suena algo en la caja de cambios y dice que por su error la cambiará poniéndole una de un desguace.
Me inquietud es mucha, ¿qué consecuencias puede tener que le ponga una usada ? ¿Qué opináis de la reparación que está haciendo?